Envío de jobs - Nodo submit
Requerimientos
- Tener acceso a los recursos a través de alguna convocatoria.
- Estar registrado en el sistema IAM for "Grid UNAM"
- Para usuarios UNAM mediante su cuenta RIU del IdP de la UNAM.
- Para usuarios externos solicitar su registro aquí.
- Contar con una cuenta en el nodo submit de la dependencia a la que pertenece el usuario o proyecto. Puede consultar la guía sobre el acceso al nodo submit aquí.
Carga del módulo gridunam
Los nodos submit cuentan con herramientas para poder hacer uso de la GridUNAM. Dichas herramientas están incluidas en un módulo de software el cual está disponible en su cuenta del nodo submit. Para poder cargar el módulo, ejecute el siguiente comando:
$ module load gridunam
Con el siguiente comando puede verificar que el módulo se cargó correctamente:
$ module list
Nota
Cargar el módulo de software como se indica, es necesario para poder hacer uso de los comandos que se encuentran en esta guía.
Autorización para la generación de tokens.
Para poder realizar cualquier operación en los clusters de GridUNAM, es necesario generar tokens de autenticación. Se debe autorizar su cuenta del nodo submit en el sistema IAM de GridUNAM para la generación de tokens.
Importante
El siguiente procedimiento (la autorización de la cuenta para generar tokens) sólo es necesario realizarlo una vez en el nodo submit donde se encuentre su cuenta. Una vez realizado, puede utilizar cualquier comando de GridUNAM (comandos que empiezan por "gu_") para hacer uso de la GridUNAM.
Registro de la cuenta en el sistema IAM
- Utilice el siguiente comando para autorizar su cuenta del nodo submit en el sistema IAM:
$ gu_activar_acceso_gridunam
https://grid.atmosfera.unam.mx/device e ingresar el código (en rojo) que se muestra en la pantalla.
De forma alternativa, puede utilizar el código QR que se desplega en su pantalla.
- Ingrese a la URL
https://grid.atmosfera.unam.mx/devicey de clic en el botón "IDP UNAM (RIU)"
Esto redireccionará hacia las siguientes pantallas, donde debe dar clic en el botón "National Autonomous University of Mexico" y a continuación en el botón "Sign in with IDP".
La siguiente pantalla le solicitará su usuario y contraseña de RIU. Ingrese sus datos y de clic en el botón "Iniciar sesión".
Si los datos ingresados son correctos, le solicitará el código que se muestra en la primera pantalla arriba del código QR. Ingrese el código y de clic en el botón "Submit".
Al ingresar el código el sistema solicitará la autorización de la cuenta. Haga clic en el botón "Authorize".
Ahora puede regresar a la terminal, donde debe de aparecer un mensaje similar a la siguiente imagen, indicando que se ha autorizado la cuenta.
Para más información sobre el manejo de tokens, puede consultar la guía "manejo de tokens".
Con este prodecimiento queda activada su cuenta en el nodo submit para la generación de tokens y uso de la GridUNAM.
Nota
Los comandos de GridUNAM, generan de forma automática los tokens de acceso.
Envío de trabajos
Una vez que se autorizó la cuenta en el sistema, puede enviar un trabajo a la GridUNAM. Para ello, puede consultar la disponibilidad de los clusters utilizando el comando siguiente:
$ gu_show_cpus_all_cluster
La salida del comando incluye cada cluster de GridUNAM y su disponibilidad en cores.
Para enviar un trabajo a la GridUNAM, utilice el siguiente comando, especificando como argumento el script para someter el trabajo (en el ejemplo "trabajo.sub") y el cluster al cual quiere enviarlo (en el ejemplo se envía al cluster de DGTIC).
$ gu_enviar_jobs trabajo.sub $dgtic
Para referirse a un cluster específico, puede guiarse con la siguiente tabla.
| Cluster | Variable en el comando |
|---|---|
| Dirección General de Cómputo y de Tecnologías de Información y Comunicación (DGTIC) | $dgtic |
| Laboratorio de Modelos y Datos de la UNAM (LAMOD) | $vlamod |
| Instituto de Astronomía, Ensenada (IA-E) | $astrosen |
| Instituto de Ciencias de la Atmósfera y Cambio Climático (ICAyCC) | $icaycc |
A continuación se presenta un ejemplo de un archivo para someter un trabajo en GridUNAM.
universe = vanilla
executable = trabajo.sh
output = trabajo.$(Cluster).$(Process).out
error = trabajo.$(Cluster).$(Process).err
log = trabajo.$(Cluster).$(Process).log
+remote_jobuniverse = 5
+remote_requirements = True
+remote_ShouldTransferFiles = "YES"
+remote_WhenToTransferOutput = "ON_EXIT"
+xcount = 4
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2023-06-06
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